Геофизические процессы и биосфера: статья

АРХЕЙНЫЕ СООБЩЕСТВА МЕРЗЛЫХ ЧЕТВЕРТИЧНЫХ ПОРОД МОРСКОГО ГЕНЕЗИСА НА ПОБЕРЕЖЬЕ о. ЗАПАДНЫЙ ШПИЦБЕРГЕН
Е.С. КАРАЕВСКАЯ1,2
Н.Э. ДЕМИДОВ1
В.С. КАЗАНЦЕВ3
И.М. ЕЛИЗАРОВ4
А.Г. КАЛОШИН5
А.Л. ПЕТРОВ5
Д.С. КАРЛОВ6
Л. ШИРРМАЙСТЕР7
А.А. БЕЛОВ8
С. ВЕТТЕРИХ7
1 ГНЦ РФ «Арктический и антарктический научно-исследовательский институт»
2 Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН
3 Институт физики атмосферы имени А.М. Обухова РАН
4 Федеральный исследовательский центр «Фундаментальные основы биотехнологии» РАН, Институт микробиологии имени С.Н. Виноградского РАН
5 Научно-аналитический центр, Апрелевское отделение Всероссийского научно-исследовательского геологического нефтяного института
6 Всероссийский научно-исследовательский институт сельскохозяйственной микробиологии
7 Институт Альфреда Вегенера Центра полярных и морских исследований имени Гельмгольца
8 Московский государственный университет имени М.В. Ломоносова
Журнал: Геофизические процессы и биосфера
Том: 20
Номер: 3
Год: 2021
Страницы: 20-38
УДК: 577+579+550.72
DOI: 10.21455/GPB2021.3-2
Информация об авторах
Аннотация
Библиографический список
Ключевые слова: о. Западный Шпицберген, вечная мерзлота, морские осадки, домен Archaea, V4 регион гена 16S рРНК, метан
Аннотация: Исследовано разнообразие домена Archaea образцов вечной мерзлоты, полученных при бурении мерзлых четвертичных отложений морского генезиса на восточном побережье залива Гренфьорд о. Западный Шпицберген. Исследование основано на анализе V4 региона гена 16S рРНК, проведенного с помощью секвенирования нового поколения. Это вторая часть работы по изучению прокариотного состава мерзлоты о. Западный Шпицберген, первая часть посвящена домену Bacteria. Основными обнаруженными филумами домена Archaea были Euryarchaeota , Bathyarchaeota , Thaumarchaeota и Asgardarchaeota . В результате филогенетического анализа доминирующих оперативных таксономических единиц были обнаружены представители метаногенных метан- и аммонийокисляющих архей, а также гетеротрофных архей. Метаногенные археи филума Euryarchaeota класса Methanobacteria обнаружены в мерзлоте спорного генезиса, тогда как метанокисляющие археи класса Methanomicrobia порядка Methanosarcinales были обнаружены в морской мерзлоте м. Финнесет: группа ANME-2a, -2b - в слоях 8.6 и 11.7 м, а группа ANME-2d ( Candidatus Methanoperedens ) - в слое 6.5 м. Аммонийокисляющие археи филума Thaumarchaeota присутствовали во всех типах мерзлоты, при этом порядок Nitrososphaerales был обнаружен в мерзлоте спорного генезиса, а порядок - Nitrosopumilales в морской мерзлоте и в мерзлоте спорного генезиса. Представители филума Bathyarchaeota были обнаружены в стратиграфически наиболее древних исследуемых образцах. Суперфилум Asgardarchaeota был встречен исключительно в слоях мерзлоты с морским генезисом и представлен филумами Lokiarchaeota , Thorarchaeota и еще одной, не идентифицированной нами группой, принадлежащей к этому суперфилуму. Присутствие в мерзлоте первой морской террасы м. Финнесет на глубине 11.7 м метана, этилена и этана, а также состав архейного сообщества этой толщи дают основание предполагать, что до замерзания в ней присутствовали микробиологические процессы анаэробного окисления метана, вероятно, поступавшего из третичных пород. Полученные результаты как этой, так и предыдущей нашей работы представляют мерзлоту Шпицбергена как богатый архив генетической информации малоизученных прокариотных групп.
Список литературы: Демидов Н.Э., Караевская Е.С., Веркулич С.Р., Никулина А.Л., Саватюгин Л.М. Первые результаты мерзлотных наблюдений на криосферном полигоне Российского научного центра на архипелаге Шпицберген (РНЦШ) // Проблемы Арктики и Антарктики. 2016. Т. 1, № 4 (110). С. 67-79.

Демидов Н.Э., Борисик А.Л., Веркулич С.Р., Веттерих С., Гунар А.Ю., Демидов В.Э., Желтенкова Н.В., Кошурников А.В., Милославский М.Ю., Никулина А.Л., Новиков А.Л., Саватюгин Л.М., Сироткин А.Н. Мерзлотно-гидрогеологические условия острова Западный Шпицберген в районе российских рудников и поселков Баренцбург, Колсбей, Грумант: Новые данные и обобщение работ начиная с 1930-х годов // Геофизические процессы и биосфера. 2020. Т. 19, № 4. С. 68-93. https://doi.org/10.21455/GPB2020.4-6

Каллистова А.Ю., Меркель А.Ю., Тарновецкий И.Ю., Пименов Н.В. Образование и окисление метана прокариотами // Микробиология. 2017. Т. 86, № 6. С. 661-683.

Караевская Е.С., Демченко Л.С., Демидов Н.Э., Ривкина Е.М., Булат С.А., Гиличинский Д.А. Разнообразие архей в многолетнемерзлых отложениях оазиса Бангера и острова Кинг Джордж (Антарктида) по данным секвенирования генов 16S рРНК // Микробиология. 2014. Т. 83, № 4. С. 475-483.

Караевская Е.С., Демидов Н.Э., Казанцев В.С., Елизаров И.М., Калошин А.Г., Петров А.Л., Карлов Д.С., Ширрмайстер Л., Белов А.А., Веттерих С. Бактериальные сообщества мерзлых четвертичных пород морского генезиса на побережье о. Западный Шпицберген // Геофизические процессы и биосфера. 2021. Т. 20, № 2. С. 75-98. https://doi.org/10.21455/GPB2021.2-5

Меркель А.Ю., Тарновецкий И.Ю., Подосокорская О.А., Тощаков С.В. Анализ систем праймеров на ген 16S рРНК для профилирования термофильных микробных сообществ // Микробиология. 2019. Т. 88, № 6. С. 655-664.

Мэгарран Э. Экологическое разнообразие и его измерение. М.: Мир, 1992. 184 с.

Соловьева Д.А., Савельева Л.А., Веркулич С.Р., Зазовская Э.П. Послеледниковые изменения природной среды в районе поселка Баренцбург (остров Западный Шпицберген) // Theory and methods of Polar science: Proc. of Intern. youth sci. conf. on the polar geodesy, glaciology, hydrology and geophysics. St. Petersburg, 2018. P. 213-222. (На рус. яз.).

Чернов Р.А., Муравьев А.Я. Современные изменения площади ледников западной части Земли Норденшельда (архипелаг Шпицберген) // Лёд и Снег. 2018. Т 58 (4). С. 462-472.

Alain K., Holler T., Musat F., Elvert M., Treude T., Krüger M. Microbiological investigation of methane and hydrocarbon discharging mud volcanoes in the Carpathian Mountains, Romania // Environ. Microbiol. 2006. V. 8 (4). P. 574-590.

Alperin M.J., Reeburgh W.S. Inhibition experiments on anaerobic methane oxidation // Appl. and Anviron. Microbiol. 1985. V. 50 (4). P. 940-945.

Amaral-Zettler L.A., Rocca J.D., Lamontagne M.G., Dennett M.R., Gast R.J. Changes in microbial community structure in the wake of Hurricanes Katrina and Rita // Environ. Sci. & Tech. 2008. V. 42 (24). P. 9072-9078.

Beulig F., Røy H., McGlynn S.E., Jørgensen B.B. Cryptic CH4 cycling in the sulfate-methane transition of marine sediments apparently mediated by ANME-1 Archaea // The ISME J. 2019. V. 13 (2). P. 250-262.

Bolyen E., Rideout J.R., Dillon M.R., Bokulich N.A., C.C. Abnet, Al-Ghalith G.A., Alexander H., Alm E.J., Arumugam M., Asnicar F., Bai Y., Bisanz J.E., Bittinger K., Brejnrod A., Brislawn C.J., Brown C.T., Callahan B.J. Reproducible, interactive, scalable and extensible microbiome data science using QIIME 2 // Nat. Biotechnol. 2019. V. 37 (8). P. 852-857. Erratum in: Nat. Biotechnol. 2019. V. 37 (9). P. 1091.

Borrel G., Joblin K., Guedon A., Colombet J., Tardy V., Lehours A.C., Fonty G. Methanobacterium lacus sp. nov., isolated from the profundal sediment of a freshwater meromictic lake // Inter. J. System. and Evolution. Microbiol. 2012. V. 62 (7). P. 1625-1629.

Bueno de Mesquita C.P.B., Schmidt S.K., Suding K.N. Litter-driven feedbacks influence plant colonization of a high elevation early successional ecosystem // Plant and Soil. 2019. V. 444 (1). P. 71-85.

Сastelle C.J., Wrighton K.C., Thomas B.C., Hug L.A., Brown C.T., Wilkins M.J., Frischkorn K.R., S.G., Singh A., Markillie L.M., Taylor R.C., Williams K.H., Banfield, J.F. Genomic expansion of domain archaea highlights roles for organisms from new phyla in anaerobic carbon cycling // Cur. Biol. 2015. V. 25 (6). P. 690-701. URL: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960982215000160

Chao A. Nonparametric estimation of the number of classes in a population // Scand. J. Statistics.1984. V. 11. P. 265-270.

Cho H., Hyun J.H., You O.R., Kim M., Kim S.H., Choi D.L., Green S.J., Kostka J.E. Microbial community structure associated with biogeochemical processes in the sulfate-methane transition zone (SMTZ) of gas-hydrate-bearing sediment of the Ulleung Basin, East Sea // Geomicrobiol. J. 2017. V. 34 (3). P. 207-219.

Conrad R., Chan O.C., Claus P., Casper P. Characterization of methanogenic Archaea and stable isotope fractionation during methane production in the profundal sediment of an oligotrophic lake (Lake Stechlin, Germany) // Limnol. and Oceanogr. 2007. V. 52 (4). P. 1393-1406.

Demidov N., Wetterich S., Verkulich S., Ekaykin A., Meyer H., Anisimov M., Schirrmeister L., Demidov V., Hodson A.J. Geochemical signatures of pingo ice and its origin in Grøndalen, West Spitsbergen // The Cryosphere. 2019. V. 13. P. 3155-3169.

De Wever A., Muylaert K., Van der Gucht K., Pirlot S., Cocquyt C., Descy J.P., Plisnier P.-D., Vyverman W. Bacterial community composition in Lake Tanganyika: Vertical and horizontal heterogeneity // Appl. and Environ. Microbiol. 2005. V. 71 (9). P. 5029-5037.

Doerfert S.N., Reichlen M., Iyer P., Wang M., Ferry J.G. Methanolobus zinderi sp. nov., a methylotrophic methanogen isolated from a deep subsurface coal seam // Inter. J. System. and Evolution. Microbiol. 2009. V. 59 (5). P. 1064-1069.

Evans P.N., Parks D.H., Chadwick G.L., Robbins S.J., Orphan V.J., Golding S.D., Tyson G.W. Methane metabolism in the archaeal phylum Bathyarchaeota revealed by genome-centric metagenomics // Science. 2015. V. 350 (6259). P. 434-438.

Fadrosh D.W., Ma B., Gajer P., Sengamalay N., Ott S., Brotman R.M., Ravel J. An improved dual-indexing approach for multiplexed 16S rRNA gene sequencing on the Illumina MiSeq platform // Microbiome. 2014. V. 2 (1) P. 6.

Fardeau M.-L., Cayol J.-L., Ollivier B. Methanocalculus // Bergey’s manual of systematics of Archaea and Bacteria (BMSAB). Hoboken; New Jersey: Wiley, 2019. ffhal-02883889ff

Fonseca-García C., Coleman-Derr D., Garrido E., Visel A., Tringe S.G., Partida-Martínez L.P. The cacti microbiome: interplay between habitat-filtering and host-specificity // Front. in Microbiol. 2016. V. 7. P. 150.

Forman S.L., Lubinski D.J., Ingolfsson O., Zeeberg J.J., Snyder J.A., Siegert M.J., Matishov G.G. A review of postglacial emergence on Svalbard, Franz Josef Land and Novaya Zemlya, Northern Eurasia // Quarter. Sci. Rev. 2004. V. 23. P. 1391-1434.

Ganzert L., Bajerski F., Wagner D. Bacterial community composition and diversity of five different permafrost-affected soils of Northeast Greenland // FEMS Microbiol. Ecology. 2014. V. 89 (2). P. 426-441.

Good I.J. The population frequencies of species and the estimation of population parameters // Biometrika. 1953. V. 40. P. 237-264.

Gründger F., Carrier V., Svenning M.M., Panieri G., Vonnahme T.R., Klasek S., Niemann H. Methane-fuelled biofilms predominantly composed of methanotrophic ANME-1 in Arctic gas hydrate-related sediment // Sci. Rep. 2019. V. 9 (1). P. 1-10.

Hamdan L.J., Coffin R.B., Sikaroodi M., Greinert J., Treude T., Gillevet P.M. Ocean currents shape the microbiome of Arctic marine sediments // The ISME J. 2013. V. 7 (4). P. 685-696.

Hammer Ø., Harper D.A.T., Ryan P.D. PAST: Paleontological statistics software package for education and data analysis // Palaeontologia Electronica. 2001. V. 4, is. 1, art. 4. 9 p.

Hernández E.A., Piquet A.M.T., Lopez J.L., Buma A.G., Mac Cormack W.P. Marine archaeal community structure from Potter Cove, Antarctica: High temporal and spatial dominance of the phylum Thaumarchaeota // Polar Biol. 2015. V. 38 (2). P. 117-130.

Hoshino T., Inagaki F. A comparative study of microbial diversity and community structure in marine sediments using poly (A) tailing and reverse transcription-PCR // Front. in Microbiol. 2013. V. 4. P. 160.

Hugerth L.W., Wefer H.A., Lundin S., Jakobsson H.E., Lindberg M., Rodin S., Engstrand L., Andersson A.F. DegePrime, a program for degenerate primer design for broad-taxonomic-range PCR in microbial ecology studies // Appl. and Environ. Microbiol. 2014. V. 80 (16). P. 5116-5123.

Humlum O., Instanes A., Sollid J.L. Permafrost in Svalbard: A review of research history, climatic background and engineering challenges // Polar Res. 2003. V. 22. P. 191-215.

Imachi H., Nobu M.K., Nakahara N., Morono Y., Ogawara M., Takaki Y., Takano Y., Uematsu K., Ikuta T., Ito M., Matsui Y., Miyazaki M., Murata K., Saito Y., Sakai S., Song Ch., Tasumi E., Yamanaka Y., Yamaguchi T., Kamagata Y., Tamakai H., Takai K. Isolation of an archaeon at the prokaryote-eukaryote interface // Nature. 2020. V. 577 (7791). P. 519-525.

Jarvis G.N., Strömpl C., Burgess D.M., Skillman L.C., Moore E.R., Joblin K.N. Isolation and identification of ruminal methanogens from grazing cattle // Cur. Microbiol. 2000. V. 40 (5). P. 327-332.

Joblin K.N., Naylor G.E., Williams A.G. Effect of Methanobrevibacter smithii on xylanolytic activity of anaerobic ruminal fungi // Appl. and Environ. Microbiol. 1990. V. 56 (8). P. 2287-2295.

Jørgensen S.L., Hannisdal B., Lanzén A., Baumberger T., Flesland K., Fonseca R., Øvreås L., Steen I.H., Thorseth I.H., Pedersen R.B., Schleper C. Correlating microbial community profiles with geochemical data in highly stratified sediments from the Arctic mid-ocean ridge // Proc. of the Nat. Acad. of Sci. 2012. V. 109 (42). P. E2846-E2855.

Jørgensen S.L., Thorseth I.H., Pedersen R.B., Baumberger T., Schleper C. Quantitative and phylogenetic study of the deep sea Archaeal group in sediments of the Arctic mid-ocean spreading ridge // Front. in Microbiol. 2013. V. 4. P. 299.

Jørgensen B.B., Beulig F., Egger M., Petro C., Scholze C., Røy H. Organoclastic sulfate reduction in the sulfate-methane transition of marine sediments // Geochim. et Cosmochim. Acta. 2019. V. 254. P. 231-245.

Kato S., Ikehata K., Shibuya T., Urabe T., Ohkuma M., Yamagishi A. Potential for biogeochemical cycling of sulfur, iron and carbon within massive sulfide deposits below the seafloor // Environ. Microbiol. 2015. V. 17 (5). P. 1817-1835.

Kemnitz D., Kolb S., Conrad R. Phenotypic characterization of rice cluster III Archaea without prior isolation by applying quantitative polymerase chain reaction to an enrichment culture // Environ. Microbiol. 2005. V. 7 (4). P. 553-565.

Koene-Cottaar F.H., Schraa G. Anaerobic reduction of ethene to ethane in an enrichment culture // FEMS Microbiol. Ecol. 1998. V. 25 (3). P. 251-256.

Kumar S., Stecher G., Tamura K. MEGA7: Molecular evolutionary genetics analysis version 7.0 for bigger datasets // Mol. Biol. and Evol. 2016. V. 33, is. 7. P. 1870-1874.

Kurth J.M., Smit N.T., Berger S., Schouten S., Jetten M.S.M., Welte C.U. Anaerobic methanotrophic archaea of the ANME-2d clade feature lipid composition that differs from other ANME archaea // FEMS Microbiol. Ecol. 2019. V. 95 (7). P. fiz082.

Lai M., Laonitisatr W., Chen Y., Ding J., Wu C., Lai S. Microbial communities of spring pits in Jing-Mei River at the southeastern Taipei basin // Proc. 2010 AGU’s Western Pacific geophysics meetingWashington, USA: Amer. Geoph. Union, 2010.

Lane D.J. 16S/23S rRNA sequencing // Nucleic acid techniques in bacterial systematics / Eds E. Stackebrandt, M. Goodfellow. Chichester, UK: John Wiley & Sons Ltd, 1991. P. 115-175.

Lynch R.C., King A.J., Farías M.E., Sowell P., Vitry C., Schmidt S.K. The potential for microbial life in the highest elevation (> 6000 masl) mineral soils of the Atacama region // J. Geophys. Res. Biogeoscie. 2012. V. 117 (G2).

Mangerud J. Radiocarbon dating of marine shells, including a discussion of apparent age of recent shells from Norway // Boreas. 1972. V. 1 (2). P. 143-172.

Miller T.L., Wolin M.J., de Macario, E.C., Macario A.J. Isolation of Methanobrevibacter smithii from human feces // Appl. and Environ. Microbiol. 1982. V. 43 (1). P. 227-232.

Mitzscherling J., Horn F., Winterfeld M., Mahler L., Kallmeyer J., Overduin P.P., Schirrmeister L., Winkel M., Grigoriev M.N., Wagner D., Liebner S. Microbial community composition and abundance after millennia of submarine permafrost warming // Biogeosci. 2019. V. 16. P. 3941-3958.

Mori K., Yamamoto H., Kamagata Y., Hatsu M., Takamizawa K. Methanocalculus pumilus sp. nov., a heavy-metal-tolerant methanogen isolated from a waste-disposal site // Inter. J. System. and Evol. Microbiol. 2000. V. 50 (5). P. 1723-1729.

Nunoura T., Hirai M., Miyazaki M., Kazama H., Makita H., Hirayama H., Furushima Y., Yamamoto H., Imachi H., Takai K. Isolation and characterization of a thermophilic, obligately anaerobic and heterotrophic marine Chloroflexi bacterium from a Chloroflexi-dominated microbial community associated with a Japanese shallow hydrothermal system, and proposal for Thermomarinilinea lacunofontalis gen. nov., sp. nov. // Microbes and Environ. 2013. V. 28 (2). P. 228-235.

Okita N., Hoaki T., Suzuki S., Hatamoto M. Characteristics of microbial community structure at the seafloor surface of the Nankai Trough // J. Pure & Appl. Microbiol. 2019. V. 13. P. 1917-1928.

Ortiz-Álvarez R., Cáliz J., Camarero L., Casamayor E.O. Regional community assembly drivers and microbial environmental sources shaping bacterioplankton in an alpine lacustrine district (Pyrenees, Spain) // Environ. Microbiol. 2020. V. 22 (1). P. 297-309.

Oshiki M., Segawa T., Ishii S. Nitrogen cycle evaluation (nice) chip for simultaneous analysis of multiple n cycle-associated genes // Appl. and Environ. Microbiol. 2018. V. 84 (8). P. e02615-17.

Pan J., ChenY., Wang Y., Zhou Z., Li M. Vertical distribution of Bathyarchaeotal communities in mangrove wetlands suggests distinct niche preference of Bathyarchaeota subgroup 6 // Microb. Ecol. 2019. V. 77 (2). P. 417-428.

Park S.J., Kim J.G., Jung M.Y., Kim S.J., Cha I.T., Ghai R., Martín-Cuadrado A.-B., Rodrígues-valera F., Rhee S.K. Draft genome sequence of an ammonia-oxidizing archaeon, «Candidatus Nitrosopumilus sediminis» AR2, from Svalbard in the Arctic Circle // J. Bacteriol. 2012. P. 6948-6949.

Pires A.C., Cleary D.F., Almeida A., Cunha Â., Dealtry S., Mendonça-Hagler L.C., Smalla K., Gomes N.N.C. Denaturing gradient gel electrophoresis and barcoded pyrosequencing reveal unprecedented archaeal diversity in mangrove sediment and rhizosphere samples // Appl. and Environ. Microbiol. 2012. V. 78 (16). P. 5520-5528.

Probst A.J., Moissl-Eichinger C. «Altiarchaeales»: Uncultivated Archaea from the subsurface // Life. 2015. V. 5 (2). P. 1381-1395.

Qin W., Heal K.R., Ramdasi R., Kobelt J.N., Martens-Habbena W., Bertagnolli A.D., Amin Sh.A., Walker Ch.B., UrakawaH., KönnekeM., Moffett J.W., Armbrust E.V., Ingalls A.E., Jensen G.J. Nitrosopumilus maritimus gen. nov., sp. nov., Nitrosopumilus cobalaminigenes sp. nov., Nitrosopumilus oxyclinae sp. nov., and Nitrosopumilus ureiphilus sp. nov., four marine ammonia-oxidizing archaea of the phylum Thaumarchaeota // Inter. J. System/ and Evol/ Microbiol. 2017. V. 67 (12). P. 5067-5079.

Roussel E.G., Sauvadet A.L., Chaduteau C., Fouquet Y., Charlou J.L., Prieur D., Cambon Bonavita M.A. Archaeal communities associated with shallow to deep subseafloor sediments of the New Caledonia Basin // Environ. Microbiol. 2009. V. 11 (9). P. 2446-2462.

Salvigsen O., Høgvard K. Glacial history, Holocene shoreline displacement and palaeoclimate based on radiocarbon ages in the area of Bockfjorden, North-Western Spitsbergen, Svalbard // Polar Res. 2005. V. 25 (1). P. 15-24.

Seidel M., Graue J., Engelen B., Köster J., Sass H., Rullkötter J. Advection and diffusion determine vertical distribution of microbial communities in intertidal sediments as revealed by combined biogeochemical and molecular biological analysis // Organic Geochem. 2012. V. 52. P. 114-129.

Seitz K.W., Lazar C.S., Hinrichs K.U., Teske A.P., Baker B.J. Genomic reconstruction of a novel, deeply branched sediment archaeal phylum with pathways for acetogenesis and sulfur reduction // The ISME J. 2016. V. 10 (7). P. 1696-1705.

Shima S., Thauer R.K. Methyl-coenzyme M reductase and the anaerobic oxidation of methane in methanotrophic Archaea // Cur. Opinion in Microbiol. 2005. V. 8 (6). P. 643-648.

Smith D.R., Doucette-Stamm L.A., Deloughery C., Lee H., Dubois J., Aldredge T., Bashirzadeh R., Blakely D., Cook R., Gilbert K., Harrison D., Hoang L., Keagle P., Lumm W., Pothier B., Qiu D., Spadafora R., Vicare R., Wang Y., Wierzbowski J., Gibson R., Jiwani N., Caruso A., Bush D., Reeve J.N. Complete genome sequence of Methanobacterium thermoautotrophicum Delta H: functional analysis and comparative genomics // J. Bacteriol. 1997. V. 179. P. 7135-7155.

Sørensen K.B., Teske A. Stratified communities of active archaea in deep marine subsurface sediments // Appl. and Environ. Microbiol. 2006. V. 72 (7). P. 4596-4603.

Srinivas T.N.R., Rao S.N., Reddy P.V.V., Pratibha M.S., Sailaja B., Kavya B., Shivaji S. Bacterial diversity and bioprospecting for cold-active lipases, amylases and proteases, from bacteria of Kongsfjorden and Ny-Ålesund, Svalbard, Arctic // Cur. Microbiol. 2009. V. 59 (5). P. 537-547.

Stauffert M., Duran R., Gassie C., Cravo-Laureau C. Response of archaeal communities to oil spill in bioturbated mudflat sediments // Microbial Ecol. 2014. V. 67 (1). P. 108-119.

Stieglmeier M., Klingl A., Alves R.J., Rittmann S.K.M., Melcher M., Leisch N., Schleper C. Nitrososphaera viennensis gen. nov., sp. nov., an aerobic and mesophilic, ammonia-oxidizing archaeon from soil and a member of the archaeal phylum Thaumarchaeota // Inter. J. System. and Evol. Microbiol. 2014. V. 64, pt. 8. P. 2738.

Svendsen J.I., Mangerud J. Holocene glacial and climatic variations on Spitsbergen, Svalbard // The Holocene. 1997. V. 7 (1). P. 45-57.

Takai K., Horikoshi K. Genetic diversity of Archaea in deep-sea hydrothermal vent environments // Genetics. 1999. V.152 (4). P. 1285-1297.

Tamura K., Nei M. Estimation of the number of nucleotide substitutions in the control region of mitochondrial DNA in humans and chimpanzees // Mol. Biol. and Evol. 1993. V. 10. P. 512-526.

Teske A., Durbin A., Ziervogel K., Cox C., Arnosti C. Microbial community composition and function in permanently cold seawater and sediments from an Arctic fjord of Svalbard // Appl. and Environ. Microbiol. 2011. V. 77 (6). P. 2008-2018.

Thauer R.K. Biochemistry of methanogenesis: a tribute to Marjory Stephenson: 1998 Marjory Stephenson prize lecture // Microbiology. 1998. V. 144 (9). P. 2377-2406.

Timmers P.H., Suarez-Zuluaga D.A., van Rossem M., Diender M., Stams A.J., Plugge C.M. Anaerobic oxidation of methane associated with sulfate reduction in a natural freshwater gas source // The ISME J. 2016. V. 10 (6). P. 1400-1412.

Treude T., Krause S., Steinle L., Burwicz E., Hamdan L.J., Niemann H., Feseker T., Liebertau V., Krastel S., Berndt C. Biogeochemical consequences of nonvertical methane transport in sediment offshore northwestern Svalbard // J. Geophys. Res. Biogeosci. 2020. V. 125 (3). P. e2019JG005371.

Vanwonterghem I., Evans P.N., Parks D.H., Jensen P.D., Woodcroft B.J., Hugenholtz P., Tyson G.W. Methylotrophic methanogenesis discovered in the archaeal phylum Verstraetearchaeota // Nat. Microbiol. 2016. V. 1 (12). P. 1-9.

Vetriani C., Jannasch H.W., MacGregor B.J., Stahl D.A., Reysenbach A.L. Population structure and phylogenetic characterization of marine benthic Archaea in deep-sea sediments // Appl. and Environ. Microbiol. 1999. V. 65 (10). P. 4375-4384.

Webster G., Sass H., Cragg B.A., Gorra R., Knab N.J., Green C.J., Mathes F., Fry J.C., Weightman A.J., Parkes R.J. Enrichment and cultivation of prokaryotes associated with the sulphate-methane transition zone of diffusion-controlled sediments of Aarhus Bay, Denmark, under heterotrophic conditions // FEMS Microbiol. Ecol. 2011. V. 77 (2). P. 248-263.

Winkel M., Mitzscherling J., Overduin P.P., Horn F., Winterfeld M., Rijkers R., Grigoriev M.N., Knoblauch Ch., Mangelsdorf K., Wagner D., Liebner S. Anaerobic methanotrophic communities thrive in deep submarine permafrost // Sci. Rep. 2018. V. 8 (1). P. 1291.

Wright J.J. Microbial community structure and ecology of Marine Group A bacteria in the oxygen minimum zone of the Northeast subarctic Pacific Ocean: PhD. Dis. Univ. of Brit. Columbia, 2013.

Yanagawa K., Nunoura T., McAllister S., Hirai M., Breuker A., Brandt L., House Ch.H., Moyer C.L., Birrien J.-L., Aoike K., Sunamura M., Urabe T., Mottl M.J., Takai K. The first microbiological contamination assessment by deep-sea drilling and coring by the D/V Chikyu at the Iheya North hydrothermal field in the Mid-Okinawa Trough (IODP Expedition 331) // Front. in Microbiol. 2013. V. 4. P. 327.

Xie L.S., Xu L., He Y., Zhang Y., Wang J.H., Xu J. Archaeal diversity in the euphotic seawater at a slope in the northern South China Sea // Chin. J. Appl. Environ. Biol. 2017. V. 23. P. 21-27.

Zeglin L.H., Wang B., Waythomas C., Rainey F., Talbot S.L. Organic matter quantity and source affects microbial community structure and function following volcanic eruption on Kasatochi Island, Alaska // Environ. Microbiol. 2016. V. 18 (1). P. 146-158.